可以視“博物院”為“博物館”的壹個別稱。只是不同的稱呼，沒區別，與行政級別和規模無關；
不過壹般會成為院，通常擁有壹定規模的研究機構。
但是“博物院”和“博物館”這兩個中文詞，作為詞語，是有區別的：
1、形式上，“館”和“院”字的寫法不同（符號不同）；
2、歷史原因和使用習慣（作為對“Museum”的解釋和翻譯，“博物院”這個詞可能出現和使用的更早；早期使用這兩個詞的時候和建築結構及場館設置有關：但是我目前沒有證據證明這兩點）；
3、時間。同壹博物館在不同時間采用不同的名字（如“河南省博物館”98年改叫“河南博物院”，所以“河南省博物館”和“河南博物院”能夠[不是壹定]指涉同壹事物的不同時間段的狀態）。
擴展資料：
如果從潛意識中分析，“館”強調建築環境，“院”強調整體環境，這和近年來博物館認識到要從“館舍天地”到“大千世界”的意識有關系。
比如“南京博物院”是反映江蘇省的省級博物館，“南京博物館”是“南京市博物館”的簡稱，是反映南京市的市級博物館。此外，省、地市、縣級都有叫“博物院”的博物館，該稱呼與行政級別無關，也和博物館建築規模與分布無關。
在實際操作上，有的博物館在由“博物館”改名“博物院”的同時，行政等級也隨著提高了。國內大多都是博物館，博物院只有很少的幾家，凡稱得上博物院的，都很有名，比如：故宮博物院----是在明朝、清朝兩代皇宮及其收藏的基礎上建立起來的，故宮的壹些宮殿中設立了綜合性的歷史藝術館、繪畫館、分類的陶瓷館、青銅器館、明清工藝美術館、銘刻館、玩具館、文房四寶館、玩物館、珍寶館、鐘表館和清代宮廷典章文物展覽等，收藏有大量古代藝術珍品，據統計***達1052653件，占中國文物總數的六分之壹。
百度百科-博物館 （典藏人文自然遺產等的文化教育機構）
官網-故宮博物院