1、首先打開Desmume0.99-sun4477，在菜單中選擇-查看-屏幕布局-橫屏幕。橫屏布局的好處是，可以讓雙屏畫面達到最大化。
2、在菜單中選擇-查看-放大過濾器-HQ4X，可以達到增強模擬畫面的效果。使用筆記本的朋友，如果處理器在I3級別以下，這裏可以選擇“正常”，以保證模擬遊戲運行速度。
3、查看-?平視顯示器-顯示FPS，可以顯示模擬遊戲的運行速度，壹般該值為60，平時可以關閉顯示，在感到遊戲運行不流暢時，可以查看確認，以便對模擬器選項進行調整。
4、設置-3D設置，該項設置是Desmume的核心機能，必須勾選的選項是Enable Textures(使用貼圖紋理)，不勾選的話遊戲中會出現貼圖錯誤。建議勾選Enable Line Hack(使用線性過濾)，增強模擬畫面效果。渲染選項可以選擇OpenGL，壹些顯卡不支持OpenGL，可以選擇SoftRasterizer。
5、設置-聲音設置，按下圖設置即可，如果發現遊戲中出現聲音不正常或者爆音、雜音，可以選擇同步-N-Z-P進行嘗試修正。
6、設置-控制設置，根據個人習慣設置即可。如果按鍵顯示紅色，代表其與熱鍵沖突。在熱鍵設置中找到相應按鍵修改即可。
7、設置-仿真選項-啟用先進 Bus-Level Timing，勾選後可以修正壹些遊戲的運行BUG，但是會降低模擬速度，在遊戲正常運行的情況下，不建議勾選。
8、然後是設置-跳幀，壹般按下圖設置即可。如果電腦CPU配置較差(臺式機雙核以下，筆記本I3以下)，可以調高跳幀。