自來也利用自己的能力，躲在了蛤蟆的身體裏潛入成功，沒想到遇到了小南，隨後兩人壹番交流後，自來也把之前的忍者誤認為了是長門的身份，因為兩人的長頭發再加上輪回眼很相似。
自來也也知道佩恩的實力，畢竟是曉組織的領頭人，決定發動仙人模式，在這場戰鬥中，依然是佩恩占有了絕對的優勢，自來也無奈之下暫時逃離，在蛤蟆仙人的建議下使用幻術困住了佩恩並殺死，沒想到佩恩是可以復活的，趁著自來也不備打斷了他的左臂。