其實，首先從用途上分，正如VMware網站上所說的，Workstation是用來搭建測試、臨時環境的，也就是說Workstation上面的Guest OS通常是為了測試、評估某個軟件，或者是為了臨時運行某個與當前系統不兼容的應用程序，通常不作為正式的系統、特別是服務器系統使用。而VMware Server則可以看成是VMware公司的旗艦產品——GSX的壹個免費入門版，其上面通常會同時運行多個Guest OS，並且是作為穩定的服務器系統運行的，換句話說，壹臺服務器上安裝了VMware Server之後，就可以作為幾臺虛擬服務器使用。從某種角度講，如果在VMware Server上只運行壹臺VM，也就沒有什麽意義了。
那麽，從技術角度上看兩者有什麽不同呢？VIRTUALIZATION.INFO在5月10日的壹篇文章中，比較了兩者的最新版本：VMware Workstation 6.0.0 (5月9日發布)和 VMware Server 1.0.3 (4月26日發布)。由於兩者面向的市場不同，這個比較可能沒有什麽實際意義，但是由於在新版本的Workstation中包含了很多server-like的特性，在壹些模棱兩可的環境中還是值得參考的。
此外，VMware Server還不支持WinXP Home/Pro、Win2000 Pro等不是服務器版本的OS作為Host OS。