異地住院醫保報銷流程如下：
1、按當地醫保規定，到異地看病人員應先到參保地的醫保經辦部門辦理異地就醫登記備案手續，在異地就醫發生的醫療費用由本人先行墊付，就醫結束後，憑相關票據到參保地的醫保經辦機構辦理報銷手續。
2、如果參保地與就醫地實現醫保聯網結算，需到異地的人員按當地醫保相關規定辦理異就醫手續後，即可到就醫地刷醫保卡就醫，直接結算醫療費用，不需本人墊付醫療費用後報銷，這種方式目前在有的省內已實現，有的地方也實現跨省之間的聯網結算。
3、參保地與參保人要去的就醫地建立了醫保代報銷協作關系，這樣參保人只要按規定在參保地的醫保經辦部門辦理了相關的登記備案手續後，在就醫地發生的醫療費用只直接委托就醫地的醫保經辦機構辦理報銷。
法律依據：《中華人民***和國社會保險法》第二十九條 參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。
社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。
《國家衛生計生委、財政部關於新型農村合作醫療異地就醫聯網結報的補充通知》第三條規範異地就醫結算資金支付流程：參合人員經規範轉診跨省異地就醫時，出院只需支付個人自付費用，定點醫療機構先行墊付異地就醫結算補償費用。定點醫療機構定期向就醫地省級新農合經辦機構提交回款材料，申請墊付資金回款。就醫地省級新農合經辦機構審核定點醫療機構的墊付資金申請材料，按照核定金額定期向定點醫療機構撥付異地就醫結算補償費用。對於部分占用資金較多的定點醫療機構，就醫地省級經辦機構可以向其預付部分資金。