簡單來講，軟件著作權在軟件創作完成後即可獲得，就是常說的進行軟著登記，以起到類似公證的作用。
軟件專利則不同。其壹，專利必須向專利局提出申請才能獲得。其二，軟件專利申請描述的是軟件的構思。
從上面就可以看出，著作權可以使妳在別人對妳的軟件盜版時，采取保護措施，防止別人盜版。然而對於妳的競爭對手來講，他們跟妳壹樣也是軟件開發者，他們可以研究妳的軟件，理解妳的思路，按照妳的思路完全可以編出相同效果的軟件，而且也不會侵犯妳的著作權。這個時候，妳軟件中最核心的東西，即軟件的構思，著作權是無法保護到的。
而軟件專利則不同，其是以技術方案的形式申請的，就是妳軟件流程圖的內容。授權後，保護的是軟件的構思，他人采用該構思，就可能構成侵權。因此軟件專利的保護力度比軟件著作權要大的多，能保護軟件最核心的東西。
另外，二者所采用的法律依據也不壹樣。
軟件的著作權保護依據是《著作權法》和《計算機軟件保護條例》，軟件的專利權保護依據是《專利法》。
當然了，不是說軟件專利保護力度大，就采取軟件專利保護，其也有其自身的缺點。
申請專利，專利的技術資料就需要公開，專利權的維持也需每年繳納年費，專利申請審查周期是2-3年，而軟件市場的周期較短。
綜合上面所述，可以簡單總結軟件著作權和軟件專利的區別主要有以下幾個方面：
1.著作權保護的是內容不被抄襲，專利保護的是方法不被盜用。
2.著作權在作品完成即可受保護，專利必須通過申請審核後才能受到保護。
3.軟件都受版權保護，但是只有有創造性、新穎性、實用性的軟件技術才能申請專利。
4.高新企業認定及相關政府項目軟件著作權也是認可的，且可加急辦理，相對於專利的長周期性，著作權在這方面具有壹定的優勢的。