動物防疫制度流程：
1、自覺遵守《動物防疫法》、《畜牧法》、《畜禽標識和養殖檔案管理辦法》 等法律法規,堅持“預防為主，防治結合，防重於治”原則，預防動物疫病發生，提高提高養殖效益。
2、養殖場、小區配備與養殖規模相適應的畜牧獸醫技術人員，建設符合動物防疫條件並依法申領《動物防疫條件合格證》 。
3、養殖場、小區法人為動物防疫工作主要責任人，負責組織落實動物防疫各項制度，定期做好場內環境清潔、消毒、滅鼠、滅蠅等工作，履行動物疫病綜防控職責。
4、提倡自繁自養，商品畜禽實行全進全出或分單元全進全出制飼養管理。
5、實行封閉性管理，生產區內禁養其他動物。定期對生產區、欄舍、用具等進行嚴格消毒。
6、禁止無關人員、動物、車輛隨意進出，對進出人員、車輛要嚴格消毒。嚴格按規定做好強制免疫、消毒、病死畜禽無害化處理、檢疫、調運備案、隔離觀察、疫情報告、疫苗使用管理、疫病監測等防控工作。
7、接受主管部門、動物衛生監管及動物疫控機構和掛牌獸醫的依法監管和抽樣監測。