司馬信深感劉備之仁義，諸葛之情誼，誓要改變歷史，助劉壹統天下。就在司馬信利用自己對歷史的先知，助劉軍節節勝利，攻下壹座又壹座城池，曹軍步步敗退，岌岌可危時，雲信擒下賣主求榮的韓良，欲將之斬首。韓良為求自保，終於私下告訴雲信自己的真實身份——司馬防之子（即司馬懿），望信放其壹條生路，日後必有重報。雲信得知後，欣喜若狂，曹最大依仗即懿，只要懿壹死，曹必滅，劉大業可成！於是私下刺死司馬懿！遂以統壹大業在望！
然世事豈盡如人意？就在此時，信收到妹決別泣淋之短信，2012世界末日，香港已經大亂，要信保重，妹永遠思念哥，永別了！司馬信方知自己已築成大錯！沒錯！正如《尋秦記》裏馬博士對項少龍所說的：“妳我存在這個空間的因素就是歷史，如果歷史改變了，妳說會怎麽樣？”沒錯！他親人所在的2000年後的空間將徹底從世間消失！
司馬信深悔不已，思前想後，終於想到解救親人的方法。信毅然離備而去，並以“司馬懿”的身份，轉投曹操！並助曹操壹步壹步奪回先前失去的城池，使歷史回歸正軌，並得以延續！當信收到妹妹報平安的欣喜短信後，終於放下心中的大石！
然劉備、諸葛等對信之背叛，雖不得原因，但終認為其是背信棄義的小人，與其反目。世上唯有桑柔，相信雲信的為人，壹直默默在其身邊，信深為之感動，終於發現自己已不知不覺中愛上了此女！終將自己的壹切告之桑柔。
曹操深感司馬信之神秘，深不可測，似乎壹切都能未蔔先知！然司馬信雖助曹操，卻始終不肯助其壹統天下，只維持三國之局面！後曹操病入膏肓，卻心疑華佗不肯接受治療，於臨死前，召見司馬信，向信吐露深埋心中的疑問！信終將壹切告之曹操！並問曹操，自己壹早就知道曹操今日之病劫，卻不救，是否怨恨自己？曹操笑而搖頭，答曰 若非雲信，恐其早已無今日！曹操問雲信能否告知今後誰能壹統天下？雲信在曹耳邊低語...曹低低地念道：“三分歸於晉...”於會心微笑中逝去...
面對諸葛之“空城計”，司馬信笑了~``明知是“空城計”，卻只能裝作不知，只為歷史不能改變...
桑柔不忍見諸葛亮對司馬信繼續誤會下去，終將壹切告之諸葛亮，諸葛終於明白司馬信之苦衷，雖嘆未能輔助蜀漢壹統天下，但還是在臨死前布下七星陣助司馬信返回現代，信返現代後終於發現諸葛亮對自己的友情（基情？！！！）從未改變...
信欲帶桑柔壹起回現代，但奈天公不允，信終於桑柔分別！雲信與桑柔各自在相隔2000年的兩個不同時空，體驗著跨時空的愛戀```好壹個“千年之戀”！... (全劇終)