FNAC是鑒別結節良、惡性最可靠、最有價值的診斷方法。其敏感性達83%，特異性達92%，準確性達95%。懷疑結節惡性變者均應進行FNAC。術前FNAC有助於術前明確癌癥的細胞學類型，確定正確的手術方案。值得註意的是，FNAC不能區分甲狀腺濾泡狀癌和濾泡細胞腺瘤。