其作用是有效遏制疫情，從某種程度上看，2003年北京小湯山“非典”醫院並沒有按照壹個完整的醫院來設計，它是特殊情況下的產物，其主要的功能是防疫和治療。
緊急建成的北京小湯山“非典”醫院，基本以物理隔離為主進行防護，醫務人員區域、病人區域、後勤保障區域均嚴格區分開。為了減少感染的可能，北京小湯山“非典”醫院設計了專門的醫護通道，病人和醫護人員分別從不同的門進出，藥物、食品的傳遞則通過雙層玻璃傳遞，不可直接接觸。
以此來保護醫護人員。事實證明，“小湯山模式”在2003年“非典”疫情中大獲成功，這其中醫院職能的純粹性和醫療設備配置的充足性功不可沒。