2003年2月2日：中國國際航空公司的CA1505航班從北京起飛後，在上午10:35分即將降落機場時，壹男子持裝滿汽油的易拉罐威脅炸機，要求將飛機飛往臺灣，隨即被安全人員制服，除2名旅客衣服部分被燒外，其余旅客均安然無恙，飛機最後於11時10分安全降落。
2005年12月25日：機場跑道外圍灌木叢發生大火，威脅機場航空油料庫，經過2小時後機場邊檢、消防將其撲滅。
2013年8月21日：從上海虹橋機場飛往福州的MF8542航班在降落後出現飛機起落架艙火警信號，隨後機上121名旅客安全撤離，後被機組人員證實為假火警。
2015年5月10日：由合肥飛往福州的幸福航空載有52人的JR1529航班在降落時沖出跑道,導致3人受傷，初步判斷可能是壹起人為原因導致的不安全事件。
2015年12月10日，從福州飛往北京的國航CA1822次航班在起飛前右引擎著火，目前火已撲滅，無人員傷亡。