壹般審計工作流程包括五個階段：
第壹個階段：預審階段所有上市公司、新三板公司必須在4月底之前披露年度報告，同時由於4月份之前有兩個重要節日，即春節和清明節，實際年報審計工作的時間不足3個半月。所以壹般會在11、12月的時候，安排會計師事務所會對公司進行財務報表預審工作。
預審工作，相對輕松些，不需要編制很規範的底稿，也不需要出具審計報告。這個階段工作內容主要包括了解公司內外部變化，形成風險評估底稿，完成內部控制測試底稿、實施涉及多科目的細節測試程序。
細節測試程序壹般內容包括：
1、獲取各月的銀行對賬單，實施銀行賬面數與銀行對賬單雙向核對；
2、對期末余額較大的應收賬款，大額發生額的銷售業務實施細節測試，獲取銷售合同、發票、出庫單、驗收單等原始單據；
3、對期末余額較大的存貨、應付賬款，大額發生額的采購業務實施細節測試，獲取采購合同、發票、入庫單等原始單據；
4、對增加的長期資產，抽查合同、完工驗收單、發票；對在建工程實施細節測試獲取合同；
5、對銀行借款實施所有發生額查驗，獲取貸款合同、擔保抵押合同、銀行借據等；
6、獲取增值稅納稅申報表、企業所得稅匯算清繳報告、整理編制賬面數與申報表核對表；
7、抽查員工工資表，同期比較分析單位工資的波動原因；
8、抽查費用，營業外收支大額發生額和特殊事項，獲取相應的合同和發票、特殊事項的原始資料。例如訴訟事項需要獲取法院判決文書；政府補助需要獲取有關部門的紅頭文件及收款收據等；
第二階段：盤點接近12月31日後的壹個星期是會計師事務所最忙的時候，每個審計員都被安排到不同的項目上，對各種公司進行年報盤點工作。盤點主要包括：存貨盤點、現金盤點、固定資產盤點、在建工程建設狀態現場查看等
第三個階段：詢證多數企業會在1月15號左右，完成上壹個年度的賬務處理工作。這個時候審計人員根據企業導出來的最末級科目余額表，對往來款發函抽樣，制作函證，並根據企業提供的地址進行往來款函證；根據企業提供的各銀行賬戶信息，理財信息、貸款余額信息等，編制銀行詢證函，親自在企業人員陪同下前往銀行詢證或根據企業提供的地址進行快遞發函；
第四個階段：現場審計之所以會有前面三個階段，就是為了縮短現場審計的時間，避免突然大量繁重的工作內容整垮財務部，畢竟公司還需要正常運營。畢竟4、5月份之前，公司財務部除了要應付正常審計外，還需要申報各種稅、制定年度預算等。壹般企業這個階段審計安排壹周時間左右；這個時候的現場審計內容主要包括：
1、對預審截點至資產負債表日期間的業務進行審核；
2、編制實質性程序底稿，對審計過程中發現的問題與公司財務、管理層進行必要的溝通；
第五個階段：所內整理到了最後壹個階段，所有外勤結束，這個時候需要回所，進行底稿整理，將審定報表與紙質底稿核對；列出待補資料清單讓企業補充。完成審計報告初稿的編制及底稿完成差不多的時候就需要送到風險控制部審核；審核完成後，根據審核結果，繼續修改底稿、補充資料；最後所有待補事項均解決後，就可以出具審計報告了