1、民族文化與社會發展研究所（學院）；
2、審美教育研究所（中文系）；
3、語言及語言教育研究所（英語系）；
4、旅遊規劃研究所（旅遊與經濟管理系）；
5、地理信息系統應用研究所（地理系）；
6、現代信息技術研究所（現代信息技術中心）；
7、科學與發展研究所（教育系）；
8、雲南玉溪生物化學技術研究所（化學系）；
9、新材料研究所（物理系）。
10、區域經濟研究所（旅遊與經濟管理系）
11、玉溪經濟社會發展研究中心（學院）
重點實驗室：基礎物理實驗室、有機化學實驗室、無機化學實驗室、旅遊飯店管理實驗室。
校級研究所：民族文化與社會發展研究所、玉溪經濟社會發展研究中心、玉溪師院大學生美育與素質拓展研究中心；
省級重點建設實驗室：“環境化學”、“LUPA開放源代碼”兩個實驗室。 學院學報
《玉溪師範學院學報》由雲南省教育廳主管，玉溪師範學院主辦，是集教學、科研為壹體的綜合性學術中文期刊。《玉溪師範學院學報》創建於1985年，月刊，大16開本，國內公開發行。主要刊登各科教師、研究人員、研究生等在教學和科研上的研究成果及綜述性文章。
館藏資源
玉溪師範學院圖書館建於2000年3月，其前身是成立於1978年3月的原玉溪師專圖書館。新館建築面積為16130.54㎡，***6層，有讀者閱覽座位1300多個。館藏各類紙質圖書文獻資料達585021冊。館內訂有中文期刊1067種、報紙146種、原版外文期刊24種。數字資源較豐富。有電子圖書135103冊。有各類數據庫14個：中文數據庫6 個；外文數據庫 3個；視頻數據庫2個；有自建數據庫3個；光盤有4555份；磁帶有818份。各類數字資源通過圖書館主頁免費為校園網用戶提供24小時開放服務。