原則性的差異涉及開放源碼和免費軟件這兩個術語。Java既不開放也不免費，而Linux堅持這兩個原則，至少在理論上是這樣。此外，Java倡導者也必須明白，在Linux界存在著壹個明顯的分歧，大部分Linux人士都非常註重“free”這個詞，雖然有些人是從經濟上來了解這個詞，但無論怎樣他們都堅持開放源碼的原則。盡管Linux有向各個階層推廣的趨勢，但目前來說自由軟件的積極倡導者主要來自世界各大學的學生和研究人員。他們對Linux的發展是非常關鍵的，為開發Linux和操作系統軟件輸送了大批的人才。
開放源碼和Linux的商業價值取決於那些用Linux為市場開發產品的開發人員，以及喜歡根據自己需要用Linux對操作系統進行自定義的人們。如果必要，這些人會出錢購買Linux，因為它是壹種開放的源碼。他們對Linux的發展也是至關重要的，否則，Linux將只是壹堆計算機課程和深奧的研究課題。