現代的操作系統壹般由進程管理、內存管理、文件系統、驅動程序和網絡等組成。Linux內核源碼的各個目錄大致與此相對應，其組成如下（假設相對於Linux-2.4.23目錄）：
arch：目錄包括了所有和體系結構相關的核心代碼。它下面的每壹個子目錄都代表壹種Linux支持的體系結構，例如i386就是Intel CPU及與之相兼容體系結構的子目錄。PC機壹般都基於此目錄。
include：目錄包括編譯核心所需要的大部分頭文件，例如與平臺無關的頭文件在include/linux子目錄下。
init：目錄包含核心的初始化代碼（不是系統的引導代碼），有main.c和Version.c兩個文件。這是研究核心如何工作的好起點。
mm：目錄包含了所有的內存管理代碼。與具體硬件體系結構相關的內存管理代碼位於arch/*/mm目錄下。
drivers：目錄中是系統中所有的設備驅動程序。它又進壹步劃分成幾類設備驅動，每壹種有對應的子目錄，如聲卡的驅動對應於drivers/sound。
ipc：目錄包含了核心進程間的通信代碼。
modules：目錄存放了已建好的、可動態加載的模塊。
fs：目錄存放Linux支持的文件系統代碼。不同的文件系統有不同的子目錄對應，如ext3文件系統對應的就是ext3子目錄。
Kernel：內核管理的核心代碼放在這裏。同時與處理器結構相關代碼都放在arch/*/kernel目錄下。
net：目錄裏是核心的網絡部分代碼，其每個子目錄對應於網絡的壹個方面。
lib：目錄包含了核心的庫代碼，不過與處理器結構相關的庫代碼被放在arch/*/lib/目錄下。
scripts：目錄包含用於配置核心的腳本文件。
documentation：目錄下是壹些文檔，是對每個目錄作用的具體說明。