首先會介紹口袋妖怪的世界觀（想必大家再熟悉不過了吧？），會讓妳編輯主人公及對手姓名。編輯之後，讓我們進入口袋妖怪的世界開始奇特的旅程吧（...）
註：本攻略主人公姓名參考動畫采用“小智”，對手則為“小茂”，其他人物同樣
先下樓,走出家門。這就是小智的故鄉真新鎮。
按照約定，小智要去口袋妖怪界的權威大木博士那裏領取自己的口袋妖怪（以下簡稱PM）。可來到研究所卻發現博士不在，而他的孫子小茂也在那裏等著博士。無奈下，小智決定到真新鎮外面轉轉。沒想到剛邁出鎮子壹步，就被人叫住了，原來是大木博士，他說不帶著PM到野外去是很危險的。這時，草叢中突然出現了壹只野生的皮卡丘，博士二話沒說就給收服了（汗...）。
博士將小智帶到研究所，給了他和小茂各壹只PM（小茂的是伊布，小智的則是剛剛抓到的皮卡丘）。
小智的皮卡丘比較特別，它不喜歡呆在妖怪球裏，所以就會壹直跟在小智身後，妳可以時常跟它聊天，看看它對妳感覺如何。
小智剛要離開研究所，卻被小茂攔住說要和他的PM比試壹番，小智正好也想試試自己PM的實力，於是就答應了（第壹場戰鬥很簡單，只要不停用電擊就能獲勝）。勝利之後可以回到家，電腦裏有壹個小回復藥，之後真正的冒險開始了。
向上走，來到常磐市，這裏的會館（以下稱為GYM）沒有開放，不能挑戰，於是小智想繼續前進，但有位老先生死活不讓過，不得已先在城市裏轉轉吧！在常磐市的商店，小智得到了寄給大木博士的包裹，於是便返回了真新鎮的研究所。
博士得到包裹後十分感謝小智，正在他誇獎小智時，小茂回來了。博士便將PM圖鑒（能記錄捕捉的妖怪，重要道具）給了兩人。
這時去小茂家，他的姐姐會把關東地圖（可以方便定位）送給小智。完成了任務，繼續冒險。
回到常磐市，發現老先生已經把路讓開了，為了表達對剛才的事表示歉意，他還教給小智如何捕捉PM。繼續前進就會進入常磐森林。
（註：若由常磐市向左走，會遇見小茂並發生戰鬥）
常磐森林裏有許多綠毛蟲和鐵甲蛹，而且小智在這裏還第壹次遇見訓練師們的挑戰。在壹步步穿越常磐森林後，小智來到了第二個城市——尼比市。
這裏的GYM是可以挑戰的。但館主使用的是小拳石和大巖蛇，因為有地面屬性的緣故，小智皮卡丘的電擊是無效的！如果用電光石火硬拼的話，對巖石系的妖怪也構不成威脅。所以最好去捉壹只猴怪或綠毛蟲（Lv10進化成巴大蝴），這樣就可輕松取勝。擊敗館主小剛後，得到巖石徽章和技巧機（可以教給妖怪特定的技巧，但使用後會消失）。
在尼比市的右方是月見山。山洞入口處的口袋妖怪中心（以下簡稱PC）裏有個大叔500元兜售鯉魚王，買不買看自己喜好。月見山中有較珍稀的PM皮皮，喜歡的玩家可以將其收服。在山中小智得到了古代PM的化石（二選壹），同時遇到了邪惡組織火箭隊的三飯桶（武藏、小次郎和喵喵）。激戰過後，小智離開了月見山。來到了水都——華藍市。
華藍市GYM館主小霞使用的是水系的PM，小智用皮卡丘輕松獲得了勝利，得到了水之徽章和技巧機泡沫光線。在城市裏轉了壹圈發現沒有路，於是小智只好朝北方前進。路上又遇見了小茂，這次他有了新的PM——烈雀，不過在皮卡丘強大的電擊攻勢下終於還是敗了。臨走前，小茂提到了正輝的家。小智決定去那裏瞧壹瞧。
（註：路上可以從別人手中得到小火龍，千萬別錯過！）
走進正輝的家，除了壹臺奇怪的機器連壹個人影也沒有，小智剛要離開，卻傳來要他操縱電腦的聲音。懷著好奇心小智照著去做了。突然，那臺機器的門開了，從裏面走出了壹個人。原來他就是正輝。因為實驗的關系不小心被困在了機器裏。為了答謝小智，正輝贈送了壹張船票，並告訴了小智船的方位——枯葉市。看了看地圖，小智朝著新目標進發了。
回到華藍市，發現原本擋在壹幢民宅前的警察已經移開了。走進屋子，發現壹片狼籍。詢問後才得知是遭遇強盜了，而元兇就在屋後。於是小智從後門出去了。原來是火箭隊的人，不能放過！解決掉他之後得到了技巧機挖洞。
（註：若在和皮卡丘的好感度高的情況下去華藍市PC旁邊的民宅可以得到秒蛙種子）
對照地圖壹路向南來到港口城市枯葉市。這裏可以從民家中得到破魚桿（只能釣到鯉魚王）。在PM俱樂部裏聽完會長的長篇大論後可以得到自行車兌換卷，有了它就可以在華藍市自行車商店換到原本天價的自行車。枯葉市的GYM前被壹棵灌木擋著，現在還過不去，先上船吧！
進入豪華油輪聖特安努號。果然是豪華油輪，總***有3層，在2樓的船長室門前，小智又遇到了小茂，這次他強了不少，要小心對付。隨後進入船長室。船長說他後背癢癢，讓小智幫他撓（汗死）。幫船長撓完背，作為獎勵得到了秘傳機01（不同於普通技巧機，使用後不會消失，但相應的，PM也不會忘記該技能）——居合斬，有了它就可以斬斷GYM前的灌木了。
（註：船上有不少好道具，壹定盡量拿全，因為之後船就會開走，沒機會了）
電系GYM裏有道雙重密碼門，需要先在垃圾桶下找開關才能解鎖。規律是找到第壹個開關，第二個壹定在第壹個周圍。打開密碼門後，見到了館主馬誌士，小心應付，不行就去捉只地鼠。勝利後得到橙色徽章和技巧機十萬伏特。通過地鼠洞返回尼比市附近的話，可以在關卡處得到秘傳機05——閃光（前提是要收復10種PM）
（註：在枯葉市正中央的警察處可獲得傑尼龜）
返回華藍市，斬斷原先擋路的灌木便可來到巖山隧道。隧道中壹片漆黑，而且布滿了訓練師，很容易就陷入戰鬥（真不明白那些訓練師是怎麽在那麽黑的地方看見玩家的，難道是超聲波定位......）。沒關系使用剛得到的閃光技巧就可以使山洞變亮。
通過巖山隧道，來到了紫苑鎮，這裏有壹座幽靈塔，塔中都是“幽靈”。在2層遇見小茂，同往常壹樣，開戰。掌握好屬性戰術可以輕松獲勝。在通向塔頂的臺階處，小智被幽靈擋住了去路，無奈之下只好離開。鎮南邊是水道，但路中間被正在睡覺的卡比獸擋住了，小智只得向西邊進發。
進入黃金城的時候突然被警衛攔住，無論如何都不讓進入。鑒於此，小智只好走地下通道來到了繁榮的玉蟲市。這座城市裏有壹座大商廈，裏面出售各種商品包括進化石。GYM館主莉佳使用的是草系PM。擊敗她之後可以得到彩虹徽章和技巧機大力抽取。城市西邊同樣被壹只卡比獸擋著去路，不過卡比獸右側有壹棵灌木，斬斷後進入可以發現隱藏道路，路的盡頭可以得到秘傳機02——飛天。
在玉蟲市的遊戲中心，小智發現壹個可以的人正在看海報。上去交談時，那個人卻不分青紅皂白的和小智開打。不過他的實力不怎麽樣，沒兩回合就敗下陣來跑掉了。小智調查了壹下海報，發現後面有個機關，於是按了壹下，沒想到墻角的墻壁居然打開了。原來這兒是火箭隊的秘密基地。小智決心將它搗毀。要先找到電梯鑰匙，才能使用電梯。壹路打到最深處，遇到了火箭隊老大阪木，這家夥實力不俗，用水系PM打會輕松些。勝利後得到透視鏡。這下可以看清楚幽靈塔幽靈的真面目了：原來都是鬼斯和鬼斯通。而擋路的幽靈是嘎拉嘎拉的靈魂。安撫完它的靈魂後來到塔的頂層，發現火箭隊的三飯桶在為難富士老人，小智立即將他們擊敗。富士老人將小智帶回自己的家，並將可以喚醒沈睡的PM的妖怪笛子送給了小智。現在就去將卡比獸喚醒吧！
卡比獸的能力很高，且只有兩只，壹定要收服！
小智沿著海邊的木架路向南走，途中得到了中級釣竿，繼續前進來到了淺紅市。
（這裏也可以走自行車高速路）
淺紅市GYM館主阿桔使用的是毒系PM，用超能和地面屬性會取得非常好的效果。戰勝他後取得粉紅徽章和技巧機劇毒。淺紅市有個狩獵區，500元可以狩獵壹次（會發給妳30個專用妖怪球）。狩獵區裏有不少枕珍稀PM。在狩獵區裏還能得到秘傳機03——乘浪和金牙齒。將金牙齒交給市長的話可以得到秘傳機04——怪力。
妳可能要問黃金城如何進入，方法很簡單。到大商廈頂層買壹瓶水交給黃金城的門衛就可進入了。GYM館主是娜姿，使用凱西、勇吉拉和胡地，實力不能小覷，建議用卡比獸。勝利後得到黃金徽章和技巧機預知未來。黃金城內有壹座很高的建築物，那是希魯夫公司的總部。裏面都是火箭隊的人小智壹路戰鬥，在到頂層前，小茂又出現了，這次他的實力有了很大幅度的增強，不行就S/L吧。擊敗小茂後可以從別人手中得到乘龍。之後便是和阪木的戰鬥。還是壹樣，使用水系或者草系的PM與之對抗吧。勝利之後能從希魯夫公司董事長那裏得到大師球（能抓住任何PM的究級球）。
（註：黃金市還有壹個格鬥道館，戰勝館主後可以得到沙瓦郎或艾比郎（二選壹）~）
從真心鎮用乘浪向下前進可以到達紅蓮島。島上的GYM大門緊閉，要先找到鑰匙。鑰匙就在GYM旁邊的廢棄研究所的地下壹層。之後就可以去挑戰館主夏伯。他使用的是火系PM，戰勝他不是什麽難事兒。獲勝後得到火焰徽章和技巧機大字篝火。
（註：這裏的研究所可以復活原來得到的化石，從尼比市博物館後門進入得到的琥珀也可以在這裏復活）
回到常磐市，GYM已經開放了，沒想到館主竟然是阪木！不過小智迅速冷靜下來，用水系和草系的PM輕松擊敗了他（地面系的PM都用過那麽多次了，就不會換別的系），並得到了地球徽章和技巧機地裂。現在的任務就是去打4天王，不過之前還要在霸者之路前與小茂較量壹番。他的隊伍非常平衡，贏他並不容易，還是先練練級為好。戰勝後便是霸者之路。
要通過這裏並不容易，需要用到許多地圖特技，同時還有許多強大的教練（不過這裏練級到不錯）。
在艱難地通過霸者之路後，小智終於來到了石英高原。開始挑戰4天王。（建議挑戰前先買壹些回復藥）
冰天王——科拿
因為她純冰系的PM幾乎沒有且基本都有水屬性，推薦使用電系妖怪，皮卡丘打起來就會比較輕松。
鬥天王——誌霸
水系PM不可獲缺，而超能、飛行屬性PM的優勢將會十分明顯。
靈天王——菊子
對付她推薦用巖+地屬性的PM，等級夠高的話，壹只就能解決掉她。
龍天王——渡
冰系絕招非常有效，只要我方PM速度夠快，打起來將異常輕松。
打完4天王，就要挑戰關東地區的冠軍，沒想到他竟然是小茂（好小子，速度挺快嘛）
他的PM十分強金，招數搭配也多種多樣，合理的屬性以及很高的等級令人望而生畏。不過這對經歷過大風大浪的小智來說已經不算什麽了，壹場激烈的戰鬥過後，小智終於獲得了勝利。這時大木博士來了，他誇獎了小智壹番，便帶著小智來到了勝利者殿堂，將自己的名字永遠地留在了這裏……。。。