體重不增是營養不良的早期表現。隨營養失調日久加重，體重逐漸下降，患兒主要表現為消瘦，皮下脂肪逐漸減少以至消失，皮膚幹燥、蒼白、皮膚逐漸失去彈性、額部出現皺紋如老人狀、肌張力逐漸降低、肌肉松弛、肌肉萎縮呈“皮包骨”時、四肢可有攣縮。皮下脂肪層消耗的順序首先是腹部，其次為軀幹、臀部、四肢、最後為面頰。皮下脂肪層厚度是判斷營養不良程度的重要指標之壹。營養不良初期，身高並無影響，但隨著病情加重，骨骼生長減慢，身高亦低於正常。輕度營養不良，精神狀態正常，但重度可有精神萎靡，反應差，體溫偏低，脈細無力，無食欲，腹瀉、便秘交替。合並血漿白蛋白明顯下降時，可有凹陷性浮腫、皮膚發亮，嚴重時可破潰、感染形成慢性潰瘍。重度營養不良可有重要臟器功能損害，如心臟功能下氏可有心音低鈍，血壓偏低，脈搏變緩，呼吸淺表等。
常見的並發癥有營養性貧血，以小細胞低色素性貧血最為常見，貧血與缺乏鐵、葉酸、維生素B12、蛋白質等造血原料有關。營養不良可有多種維生素缺乏，尤以脂溶性維生素A、D缺乏常見。在營養不良時，維生素D缺乏的癥狀不明顯，在恢復期生長發育加快時癥狀比較明顯。約有3／4的病兒伴有鋅缺乏，由於免疫功能低下，故易患各種感染，如反復呼吸道感染、鵝口瘡、肺炎、結核病、中耳炎、尿路感染等；嬰兒腹瀉常遷延不愈加重營養不良，形成惡性循環。
營養不良可並發自發性低血糖，患兒可突然表現為面色灰白、神誌不清、脈搏減慢、呼吸暫停、體溫不升但無抽搐，若不及時診治，可致死亡。
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