在第三方支付交易流程中，支付模式使商家看不到客戶的信用卡信息，同時又避免了信用卡信息在網絡上多次公開傳輸而導致信用卡信息被竊。
第壹步，客戶在電子商務網站上選購商品，最後決定購買，買賣雙方在網上達成交易意向。
第二步，客戶選擇利用第三方作為交易中介，客戶用信用卡將貨款劃到第三方賬戶；
第三步，第三方支付平臺將客戶已經付款的消息通知商家，並要求商家在規定時間內發貨；
第四步，商家收到通知後按照訂單發貨；
第五步，客戶收到貨物並驗證後通知第三方；
第六步，第三方將其賬戶上的貨款劃入商家賬戶中，交易完成。
第三方支付交易流程中，支付模式使商家看不到客戶的信用卡信息，同時又避免了信用卡信息在網絡上多次公開傳輸而導致信用卡信息被竊。
二、第三方支付流程優缺點
成本優勢；支付平臺降低了政府、企業、事業單位直連銀行的成本，滿足了企業專註發展在線業務的收付要求。
競爭優勢；第三方支付平臺的利益中立，避免了與被服務企業在業務上的競爭。
創新優勢；第三方支付平臺的個性化服務，使得其可以根據被服務企業的市場競爭與業務發展所創新的商業模式，同步定制個性化的支付結算服務。
風險問題；在電子支付流程中，資金都會在第三方支付服務商處滯留即出現所謂的資金沈澱，如缺乏有效的流動性管理，則可能存在資金安全和支付的風險。同時，第三方支付機構開立支付結算賬戶，先代收買家的款項，然後付款給賣家，這實際已突破了現有的諸多特許經營的限制，它們可能為非法轉移資金和套現提供便利，因此形成潛在的金融風險。
電子支付經營資格的認知、保護和發展問題；第三方支付結算屬於支付清算組織提供的非銀行類金融業務，銀行將以牌照的形式提高門檻。因此。對於那些從事金融業務的第三方支付公司來說，面臨的挑戰不僅僅是如何贏利，更重要的是能否拿到將要發出的第三方支付業務牌照。
第三方支付是指具備壹定實力和信譽保障的獨立機構，采用與各大銀行簽約的方式，通過與銀行支付結算系統接口對接而促成交易雙方進行交易的網絡支付模式。
在第三方支付模式，買方選購商品後，使用第三方平臺提供的賬戶進行貨款支付（支付給第三方），並由第三方通知賣家貨款到賬、要求發貨；買方收到貨物，檢驗貨物，並且進行確認後，再通知第三方付款；第三方再將款項轉至賣家賬戶。
2017年1月13日下午，中國人民銀行發布了壹項支付領域的新規定《中國人民銀行辦公廳關於實施支付機構客戶備付金集中存管有關事項的通知》，明確了第三方支付機構在交易過程中，產生的客戶備付金，今後將統壹交存至指定賬戶，由央行監管，支付機構不得挪用、占用客戶備付金。
2018年3月，網聯下發42號文督促第三方支付機構接入網聯渠道，明確2018年6月30日前所有第三方支付機構與銀行的直連都將被切斷，之後銀行不會再單獨直接為第三方支付機構提供代扣通道。
網上第三方支付流程
1.網上消費者瀏覽檢索商戶網頁.
2.網上消費者在商戶網站下訂單.
3.網上消費者選擇第三方支付平臺，直接鏈接到其安全支付服務器上，在支付頁面上選擇自己適用的支付方式，點擊後進入銀行支付頁面進行支付操作.
4.第三方支付平臺將網上消費者的支付信息，按照各銀行支付網關的技術要求，傳遞到各相關銀行
5.由相關銀行(銀聯)檢查網上消費者的支付能力，實行凍結、扣帳或劃帳，並將結果信息傳至第三方支付平臺和網上消費者本身
.6.第三方支付平臺將支付結果通知商戶
7.支付成功的，由商戶向網上消費者發貨或提供服務
8.各個銀行通過第三方支付平臺向商戶實施清算.