1、系統的技術架構比較
分層是將系統進行有效組織的方式，分而治之的思想是計算機領域中非常重要的思想。在好的分層思想引導下，便能實現“高內聚、低耦合”，也能將具體的問題割裂開來，易於控制、易於延展，更易於分配資源。PHP只能實現簡單的分布式兩層或三層的架構，而JAVA在這方面就十分強大，可以實現多層的網絡架構。運用MVC的設計模式，可使oa系統具有更加高效、合理的系統架構。技術架構的落後，使運用php編寫的oa軟件系統先天不足，而後天又無法補足其先天上的劣勢。使得系統在可拓展性、需求應變性上與JAVA編寫的oa軟件系統的差距越來越大。架構的差距，註定了php做的oa充其量是個小家碧玉，始終無法和java這種大家閨秀同臺競技。
2、數據庫訪問比較
PHP可編譯成具有與許多數據庫相連接的函數。將自己編寫外圍的函數去間接存取數據庫。通過這樣的途徑當更換使用的數據庫時，可以輕松地修改編碼以適應這樣的變化。但PHP提供的數據庫接口支持彼此不統壹，比如對Oracle, MySQL，Sybase的接口，彼此都不壹樣。由於PHP對於不同的數據庫采用不同的數據庫訪問接口，所以數據庫訪問代碼的通用性不強。
而Java通過JDBC來訪問數據庫，通過不同的數據庫廠商提供的數據庫驅動方便地訪問數據庫，訪問數據庫的接口比較統壹。如果同樣是將開發的web應用從MYSQL數據數轉到ORACLE數據，PHP需要做大量的修改工作，而且比較繁瑣。但JAVA開發的便只需要很少的更改便能實現。
數據庫訪問方式的差異，奠定了php開發出的oa和java開發出來的oa是馬車和火車的差距，前者只能亦步亦趨而且額度有限，後者卻是工業化的結晶，不僅能夠包容萬物而且速度上穩步提升。
3、安全性對比
在同是開源和跨平臺的java面前，php丟掉了很多的優勢。在代碼的安全性上尤為突出。php的開發程序在別人拿到代碼後，可以很容易的進行修改。而java開發的程序由於無法看到完整的源代碼，只能看到壹些編譯好的類文件，所以安全性較高。加之系統架構的優勢，在安全性上php和java是相去甚遠。
如果非要將php和java在安全性上做個比較的話，同壹個小偷光顧php那是隨便拿來隨便改，想拿什麽拿什麽，拿的高興還能大筆壹輝某某到此壹遊。而光顧java的時候，便會發現警察把守，內設自動報警裝置，即便突破重重阻擾後進入居室。那值錢的東西都放在加密後的保險櫃中，只能望洋興嘆、鎩羽而歸。
4、前瞻性和拓展性
從整體來說，php適用於中小型系統，而java適用於大型系統。Php能夠將單壹的事件做好，但卻不適合完成集成度較高的多項並發事件。為什麽說php適合中小型系統而不適合做大系統呢？
首先， php缺乏多層結構支持。而對於大型的系統負荷站點，只能采用分布計算。將數據庫、應用邏輯層和表示邏輯層彼此分開，並將同層的根據流量分開，組成二維數組。而php恰恰缺乏這種支持。
其次，PHP提供的數據庫接口不統壹，要將多個不同的數據庫數據統壹需要花費很大的力氣。而JAVA則沒有這種缺陷，可通過SUN Java的Java Class和EJB獲得規模支持，通過EJB/CORBA以及眾多廠商的Application Server獲得結構支持。如IBM的E－business，它的核心是采用JSP/Servlet的Web Sphere，是通過CGI來提供支持的。
如果將Php比作將才，具備獨擋壹方的能力。那麽java便是帥才，具有較好的前瞻性和拓展性，整體布局和協同能力強。能夠指揮千軍萬馬，最後逐鹿中原。
5、開發成本比較
既然php在諸多方面都不如java優異，那麽php開發出的oa產品何以與java產品競爭呢？在於Php陣營普遍走的是低端路線，而java陣營走的是中高端路線。兩者之間交*的區域較小。
軟件價格的高低很大程度上和自身成本和功能相掛鉤。php的入門門檻較低，絕大多數學過c的程序員都很容易轉型為php程序員，這使得php程序員的泛濫成災的同時，低成本的php軟件產品也層出不窮。以PHP最經典的組合PHP + MySQL + Apache為例，由於所有軟件都是開源免費的，所以投入並不高。
而java開發需要特定的環境，成長為壹個合格的java程序員需要壹定的時間，java程序員的成本也是php成本的幾倍。Java的web應用服務器免費的有Tomcat、JBoss等，而要想具有很好的商業化服務便必須選用Web Sphere和 Web logic。這其中投入的成本無形中便超是php成本的N倍。所以，java開發oa的成本要遠遠高於php開發出來的同類軟件產品。但也正由於java開發的成本較高，很難實現抄襲和短期內逾越的可能，也使得java用開發出的產品門檻更高。
不怕不識貨，就怕貨比貨。Php開發出來的產品也能用，但是和java開出的同類產品是沒法比較的。正因為php開發的產品整體性能和java開發的相去甚遠，所以php運用低成本的低價優勢和同類的java產品抗爭，以價格落差來平衡購買者的心態。所以，PHP + MYSQL 的OA不值錢也就不足為怪了
第二種
比較PHP和JSP這兩個web開發技術，在目前的情況是其實是比較PHP和Java的Web開發。以下是我就幾個主要方面進行的比較：
壹、 語言比較
Php是解釋執行的服務器腳本語言，首先php有簡單容易上手的特點。語法和c語言比較象，所以學過c語言的程序員可以很快的熟悉php的開發。而java需要先學好java的語法和熟悉壹些核心的類庫，懂得面向對象的程序設計方法。所以java不如php好學。
Java首先要編譯成字節碼.class文件，然後在java虛擬機上解釋執行。Java的web開發首先最容易想到的就是JSP（現在已經到JSP2.0），原來的java的web開發都是用servlet來實現的，用servlet來開發需要程序員在java的源文件中嵌入大量的html代碼。所以後來就出現了JSP,JSP可以方便的嵌入到html文件當中，其實jsp文件在服務器上執行的時候首先會被應用服務器轉換成servlet，然後再編譯執行。Jsp可以通過servlet和JavaBean的支持產生強大的功能。JavaBean 是壹種可復用的、跨平臺的軟件組件。使用javabean可以方便的實現java代碼和html的分離，能夠增強系統的功能和軟件的復用性。
Java的web開發屬於SUN公司定義的J2EE其中的規範。而且在J2EE中包括了java的web開發的所有方面，如：JSP、Servlet、JDBC、JNDI、JAVABEAN、EJB等等。J2EE就特別適合於做大型的企業級的應用。
二、 數據庫訪問比較
Java通過JDBC來訪問數據庫，通過不同的數據庫廠商提供的數據庫驅動方便地訪問數據庫。訪問數據庫的接口比較統壹。
PHP對於不同的數據庫采用不同的數據庫訪問接口，所以數據庫訪問代碼的通用性不強。例如：用Java開發的web應用從MySQL數據庫轉到Oracle數據庫只需要做很少的修改。而PHP則需要做大量的修改工作。
三、 系統設計架構比較
采用Java的web開發技術，需要使用的是面向對象的系統設計方法，而PHP還是采用面向過程的開發方法。所以用Java進行開發前期需要做大量的系統分析和設計的工作。
四、 跨平臺性
Java和PHP都有很好的跨平臺的特性。幾乎都可以在不作任何修改的情況下運行在Linux或者Windows等不同的操作系統上。
五、 開發成本比較
PHP最經典的組合就是：PHP + MySQL + Apache。非常適合開發中小型的web應用，開發的速度比較快。而且所有的軟件都是開源免費的，可以減少投入。
Java的web應用服務器有免費Tomcat、JBoss等，如果需要更好的商業化的服務有：Web Sphere和 Web logic。
六、 分布式多層架構比較
PHP只能實現簡單的分布式兩層或三層的架構，而JAVA在這方面就比較強大，可以實現多層的網絡架構。數據庫層（持久化層）、應用（業務）邏輯層、表示邏輯層彼此分開，而且現在不同的層都已經有壹些成熟的開發框架的支持。例如Struts就是利用java的web開發技術實現了MVC的設計模式，而在業務邏輯層也有Spring框架，數據庫持久化層有Hibernate等框架。這些框架可以方便開發者高效、合理、科學得架構多層的商業應用。
下面簡要的說壹下Struts，它實質上是在JSP Model2的基礎上實現的壹個MVC（Model、View、Controler）框架。JSP Model2體系結構是壹種聯合使用JSP 與Servlet 來提供動態內容的方法。在Struts框架中，模型由實現業務邏輯的JavaBean或EJB組件構成，控制器由Servlet實現的，視圖由壹組JSP文件組成。采用Struts可以明確角色的定義和開發者與網頁設計者的分工。而且項目越復雜，其優勢越明顯。
七、 源代碼安全
PHP開發的程序的源代碼都是公開的，他人拿到php開發的程序後都可以進行修改。
Java開發的程序，最後用戶拿到的是只是壹些編譯好的class類，無法看到完整的源代碼，安全性高。
八、性能比較
有人做過試驗，對這兩種種語言分別做回圈性能測試及存取Oracle數據庫測試。
在循環性能測試中，JSP只用了令人吃驚的四秒鐘就結束了20000＊20000的回圈。而PHP測試的是2000＊2000循環（少壹個數量級），卻分別用了63秒。
數據庫測試中，二者分別對 Oracle 8 進行 1000 次 Insert,Update,Select和Delete： JSP 需要 13 秒，PHP 需要 69 秒。
表格 1 PHP 與Java的比較
PHP JAVA
可復用性 低 高
開發速度 快 慢
易維護性 差 優
可移植性 優－Linux、Windows、Unix等
安全性 低 高
開發費用 低 高
多層架構 差 優
數據庫訪問 接口不統壹 接口統壹
可擴展性 差 優
面向對象 差 優
綜上 PHP適合於快速開發，中小型應用系統，開發成本低，能夠對變動的需求作出快速的反應。而Java適合於開發大型的應用系統，應用的前景比較廣闊，系統易維護、可復用性較好。還有，同樣功能的系統用Java開發的系統要比PHP開發的系統的價格要高