合作社的分配實行按交易量（額）返還為主、按股金分紅為輔的盈余分配制度，這是與公司依據出資額進行利潤分配的根本不同之處。合作社可分配盈余的計算公式是：
可分配盈余=按交易量（額）返還+股金分紅
在上述公式中，需要註意三個問題：第壹，在分配順序上，首先按交易量（額）的份額向成員返還，然後再進行按股金分紅。第二，在分配比例上，每個合作社按交易量（額）返還和股金分紅在可分配盈余中所占比例，由章程或成員大會規定，但按交易量（額）比例返還的總額不得低於整個可分配盈余的60%，股金分紅總額不得高於整個可分配盈余的40%。這壹法律規定，體現了合作社以按交易量（額）二次返還為主、按股金分紅為輔的原則。合作社可分配盈余實行以按交易量（額）分配為主的辦法，是成員實現互助合作的重要體現。第三，不能以股金分紅替代按交易量（額）返還。壹些合作社只給入股成員分紅，而不按交易量（額）返還，或者以股金分紅代替交易量（額）返還，或者混淆按交易量（額）返還和股金分紅。這些做法實質上是只實行按股金分配盈余，只承認了股金對合作社發展的貢獻，與公司的分配辦法是完全壹樣的，不符合合作社分配原則。