這次的內容不多，主要分為兩部分:
我們之前了解到的是，內部準則(如等高線法或其他聚類質量指標)僅依賴於物種數據，不足以選擇最佳的樣方聚類結果。選擇最終的聚類結果有時需要基於生態學來解釋。生態學解釋可以看作是樣方聚類的外部驗證。
下面，我們將學習使用樣方簇作為因子來分析解釋變量的方差。
雖然在方差分析中以物種組成數據得到的聚類結果作為解釋變量，但從生態學的角度來看，實際上是為樣方的分組尋找環境因子的解釋。
下面可以使用作者編寫的通用函數，對環境變量進行字母分組後，進行方差分析的多重比較，顯示箱線圖的多重比較結果。不同字母表示組間差異顯著(以中線降序排列)。
根據以上分析和圖解，可以確定這組魚類群落的生態習性。
當然，我們也可以根據環境變量對樣方進行聚類(類似於生境類型的分組)，然後通過指示種分析(後面會討論)檢驗不同生境的物種分布是否存在差異。在指示物種分析過程中，需要對基於不同生境類型的物種逐壹進行分析。因此，需要考慮在分析多個物種時會出現多次試驗的統計問題。
此外，作為替代方案，第六章將提出壹種基於排序的多元方法，該方法也可以直接描述和檢驗物種-生境關系。請向前看。
想直接比較分別基於物種數據和環境數據的樣方聚類結果，應該怎麽做？
同時，列聯表分析也適用於比較分別基於物種資料和分類(定性)解釋變量資料的樣方聚類結果。
這是和環境數據對比的內容。雖然不多，但是聯系之前的學習者，還是很難掌握。主要是利用外部資料進行類型比較(方差分析)和雙類型比較(列聯表分析)，學會掌握好。
感謝您的閱讀。敬請期待下壹期《數量生態學:R語言的應用》第四章聚類分析5-聚類物種收集。
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