預後研究最常用的指標不包括發病率。
預後研究：
預後研究是研究個體的基線特征與未來結局事件發生之間的關系，以改善個體的健康狀態。對預後的研究從來沒有像現在這樣重要，因為在全球範圍內，比以往任何時候都有更多的人生活在壹種或多種疾病或亞健康狀態下。
預後模型：
預後模型主要用於告知個體其疾病未來的發展進程（或其出現特定疾病的風險），並指導醫生和患者在進壹步治療中進行***同決策。
比如，使用諾丁漢預後指數估計乳腺癌患者癌癥復發或死亡的長期風險；急性生理和慢性健康評估評分和簡化的急性生理評分預測醫院危重患者的死亡率；TNM預後分期系統預測腫瘤預後，輔助臨床治療方案制定等。
發病率：
發病率表示在壹定期間內，壹定人群中某病新發生的病例出現的頻率。是反映疾病對人群健康影響和描述疾病分布狀態的壹項測量指標。
發病率可用來反映疾病對人群健康的影響，發病率高說明疾病對健康影響大，發病率低說明疾病對健康影響較小。發病率可用作描述疾病的分布情況。通過比較不同特征人群的某病發病率，可探討病因和對防治措施進行評價。
預後分為自然預後和幹預治療預後：
自然預後：
自然預後是在未經治療的情況下，對某種疾病發展過程及其後果的預測。在627個病種中，自然預後良好的病種約占15.1%，自然預後不良的病種占55.6%，其余病種自然預後不定。
幹預治療預後：
治療預後就是通過醫學幹預，對某種疾病發展過程及其最終後果的預測，後面有重點論述。自然預後和治療預後兩者相互聯系、相互影響、相互作用。自然預後和治療預後的關聯還有復雜性的方面。壹般說來，在醫學行為的幹預下，預後會發生程度不同的改變。
但存在醫學幹預與預後關系不明顯和幹預後不發生改變的情況。分化良好的低級低期前列腺癌無論治療與否預後都良好；與之相反，分化不良的高期前列腺癌無論何種治療預後都不好；只有那些中等分化的癌，治療對其預後有影響。