coip實驗原理：當細胞在非變性條件下被裂解時，完整細胞內存在的許多蛋白質-蛋白質間的相互作用被保留了下來。
免疫***沈澱，是以抗體和抗原之間的專壹性作用為基礎的用於研究蛋白質相互作用的經典方法。是確定兩種蛋白質在完整細胞內生理性相互作用的有效方法。
其原理是：當細胞在非變性條件下被裂解時，完整細胞內存在的許多蛋白質-蛋白質間的相互作用被保留了下來。如果用蛋白質X的抗體免疫沈澱X，那麽與X在體內結合的蛋白質Y也能沈澱下來。
細胞裂解後，孵育結合了抗體的珠子，誘餌蛋白通過其抗體結合到Beads上，同時誘餌蛋白的互作蛋白，也壹起“***沈澱”到Beads上。洗滌掉未結合的蛋白後，再用洗脫液將互作蛋白復合物從Beads洗脫下來，便得到免疫***沈澱產物，產物既可用WesternBlot檢測已知蛋白，也可用質譜鑒定未知蛋白。
在免疫***沈澱實驗中沒有檢測到目的蛋白：
1、樣品中目的蛋白未表達或者表達量低。這種情況下建議確定目的蛋白的蛋白譜，確定它會表達。
2、可以適當增加裂解液，但要註意後續要將裂解液去除幹凈。
3、抗體使用量少，沒有足夠的抗體去捕獲目的蛋白。建議增加抗體的使用量。
4、緩沖液、洗脫液的pH可能不能將目的蛋白洗脫。建議根據想要洗脫的蛋白質，調整溶液正確的二pH值。
5、抗體沒有與免疫吸附磁珠結合。註意查看磁珠與抗體亞型是否匹配。
理論上，蛋白酶和磷酸酯酶抑制劑應該在使用當天同時加入（抑蛋白酶肽，亮抑酶肽，胃蛋白酶抑制劑各100μl；PMSF，Na3VO4，NaF各500μl），但是PMSF在水溶液中很不穩定，30分鐘就會降解壹半，所以PMSF應該在使用前現加，其他抑制劑成分可以在水溶液中穩定5天。