這是壹個不可預測的時代。從荷蘭和葡萄牙進口的火槍還沒有登島，只有勇士的血肉之軀才能主宰戰場。遊戲側重於戰場的細節。同壹個屏幕上通常不超過40個戰鬥單位(每邊20個左右)，每個單位都有自己明確的目的和用途，並提供升級選項。角色等級通過盔甲的顏色和背後插的旗幟來區分，比以前更容易區分。
除了獨特的亞洲人物崇拜，到處築墻的習慣也對遊戲戰役產生了實質性的影響。每個理想城市都有五層防禦體系，即使是設防區也因為靠近大海或山脈而有壹些防禦加成。
《全面戰爭》系列中經典的海戰場景也會出現在《幕府將軍2》中，不過兩艘船都是用槳驅動的，所以不用擔心風向的影響。海戰的主要模式是雙方成堆的弓箭手互相射擊，然後互相投擲鉤子，幫助雙方靠近，從而爆發壹場決定性的對接戰。不同於以往的全戰作品，首次實現了多人模式下的團隊對抗；最多可以支持8個玩家，每壹方可以使用特定的角色形象，獲得的經驗值可以針對所扮演的角色進行升級。