1，雙向凝膠電泳(2DE): 2-DE是壹種常用的蛋白質分離純化技術，可以高效分離復雜的蛋白質混合物，定量檢測不同樣品中蛋白質的差異表達。通過比較多個樣品中蛋白質的移動距離、分子量和熒光強度，可以篩選差異表達的蛋白質。
2.質譜:質譜是壹種對蛋白質序列的高精度分析方法，可以通過熒光染色、同位素標記或同位素標記結合液相色譜分離篩選差異蛋白質，然後用質譜進行檢測。該方法基於樣品中蛋白質的重量和熒光信號特征，可以識別低豐度蛋白質或成分分布較寬的蛋白質。
3.差異表達譜分析:差異表達譜分析(Differential expression profile analysis，DEP)是通過生物信息學方法對蛋白質中的全局表達譜進行比較分析，通過檢測樣品蛋白質和對照組蛋白之間的數量差異來篩選差異蛋白質。這種方法不需要首先純化樣品蛋白，並且可以檢測更多的細胞、組織和器官特異性變化。
4.蛋白質芯片技術:蛋白質芯片技術是將大量的蛋白質固定在芯片上，檢測樣品與蛋白質芯片上的蛋白質相互作用的技術。通過使用該技術，可以快速檢測多個樣品中的差異表達蛋白質，並且可以減少純化和分離的過程，從而提高分析效率和靈敏度。
篩選差異蛋白的方法有很多。壹般根據具體的研究問題、樣品類型和實驗條件選擇合適的方法進行分析。同時需要註意的是，每種方法都要進行合理的實驗設計和統計分析，以保證篩選結果的準確性和可靠性。