基因組:以生物體所有的核酸為研究對象,狹義的基因組定義為生命體的全套DNA,廣義的基因組則包含DNA、mRNA、lncRNA等參與到基因表達調控的所有核酸序列。其主要研究手段為基因測序,以華大基因為代表。轉錄組通常可認為是基因組的簡化研究手段,即所有轉錄本的集合。
蛋白組:生物體基因組所編碼的全套蛋白質。鑒於蛋白質表達的時空特異性,各組織器官或者特定亞細胞結構器(如線粒體、葉綠體),甚至是外泌蛋白,也可以成為壹個蛋白組。所以蛋白質組是信號轉導、分子發育最為直接的手段。其主要研究手段為生物質譜,在國內以牟合蛋白為典型。
代謝組:生物體內源性代謝物質的動態整體,通常只涉及相對分子質量約小於1000的小分子代謝物質。因其與蛋白質組壹樣可以很好的指針細胞、機體的生命活動狀態,所以常常被用作臨床生物標誌物的篩選。目前,代謝組的研究也只能借助生物質譜完成。
下面這幅圖能夠很好的呈現基因、代謝、生命活動間的關系:
Figure. Genomic-Proteomic-Phenotype