它們之間主要區別在於以下幾點：
1.引腳功能
引腳幾乎相同，改變是，在AT89S51 P1.5中，P1.6，P1.7具有第二功能，即這三個引腳的第二功能構成壹個串行ISP編程接口。
2.編程功能
AT89C51僅支持並行編程，而AT89S51不僅支持並行編程，還支持ISP在線編程。在編程電壓方面，AT89C51除5V外還需要12V Vpp才能正常工作，而AT89S51只需4-5V。
3.燃燒次數較多
AT89S51標稱燃燒次數為1000次，實際為1000-10000次，這更有利於啟動學習者反復燃燒，降低學習成本。
4.更高的工作頻率
AT89C51的最高工作頻率為24 MHZ，而AT89S51的最高工作頻率為33 MHZ。 （AT89S51有兩種型號，分別支持24 MHZ和33 MHZ的最大工作頻率。）因此它具有更快的計算速度。
5.更寬的功率範圍
AT89S51工作電壓範圍，高達4-5.5V，而AT89C51底部4.8V，高於5.3V時正常運行。
6.更強的抗幹擾性
AT89S51內部集成看門狗定時器，而AT89C51需要外部看門狗定時器電路，或使用單片機內部定時器組成軟件看門狗，實現軟件抗幹擾。
擴展資料
AT89C51
是壹種帶4K字節閃爍可編程可擦除只讀存儲器（FPEROM—Falsh Programmable and Erasable Read Only Memory）的低電壓，高性能CMOS8位微處理器，俗稱單片機。AT89C2051是壹種帶2K字節閃爍可編程可擦除只讀存儲器的單片機。單片機的可擦除只讀存儲器可以反復擦除100次。該器件采用ATMEL高密度非易失存儲器制造技術制造，與工業標準的MCS-51指令集和輸出管腳相兼容。由於將多功能8位CPU和閃爍存儲器組合在單個芯片中，ATMEL的AT89C51是壹種高效微控制器，AT89C2051是它的壹種精簡版本。
AT89S51
是壹個低功耗，高性能CMOS 8位單片機，片內含4k Bytes ISP(In-system programmable)的可反復擦寫1000次的Flash只讀程序存儲器，器件采用ATMEL公司的高密度、非易失性存儲技術制造，兼容標準MCS-51指令系統及80C51引腳結構，芯片內集成了通用8位中央處理器和ISP Flash存儲單元，功能強大的微型計算機的AT89S51可為許多嵌入式控制應用系統提供高性價比的解決方案。