當前位置:編程學習大全網 - 編程語言 - 學習生物信息學,需要配置怎樣的電腦呢?

學習生物信息學,需要配置怎樣的電腦呢?

首先的問題的是,我們需要什麽樣的計算機。

關於硬件:

需要至少4G內存,最好可以達到16G以上內存;

至少500G硬盤空間。通常壹個RNA-seq的數據量為20G左右,如果再加上分析之後的結果,可能達到50G,所以即使妳有500G的空間,也分析不了幾組數據。所以硬盤空間越多越好,比如說2TB或者使用高速網絡存貯界質。

CPU,至少2核。因為妳在運行程序時,通常100%占到CPU,如果沒有2核,計算機多半會假死在那裏。如果有8核,或者以上更好。

GPU,很多程序開始使用GPU運算,如果能有好的GPU顯卡,也是推薦的,但不是必須的。

為了達到以上的條件,入門極的比如說Mac Pro。進階級的就是獨立server,高級的是supercomputer clusters,支持qsub之類的。或者可以購買雲計算服務。

對於操作系統,在工作站方面,推薦Mac OS。它運行穩定,與LINUX同源。需要下載安裝Xcode和wget就可以了。當然妳還可以很方便的安裝office辦公軟件,以及photoshop,AI等工具。最後安裝好R/Bioconductor,就可以開始工作了。如果買了兼容機,可以安裝上Linux/UNIX系統。它在安裝上R/Bioconductor之後基本上就可以了。它的缺點是辦公軟件,繪圖軟件的安裝。最差的就是Windows了。需要安裝比如GCC編譯器,make工具,mingw64, perl, zip/unzip, tar, wget, ghostscript等等。

有了軟件及硬件,接下來的工作就是了解壹些常識以武裝妳的大腦,這是整個運行環境中最重要的壹環。首先,妳需要學習了掌握UNIX常用命令,並且不反感字符界面。其次學會安裝,設置及構建網絡服務,比如apache的websever,以及mysql的數據庫服務。第三安裝及設置壹個Galaxy。當然,第二步及第三步可能會有難度,可以先使用Galaxy本身的服務,但是它有很多限制,所以最好還是自己安裝壹個比較好。第四步,學習壹門計算機語言,比如c, python, ruby, java等,還有壹門腳本式語言工具,比如perl。第五步,學習使用R/Bioconductor。第六步,統計學。

至此,妳的NGS分析環境就設置完成了。如果快的話,妳可以兩三個月就設置完成,達到起步的階段,之後就是漫長的學習過程。慢的話,四年本科也不壹定學到多少。

  • 上一篇:幻影2000的模型制作圖
  • 下一篇:哪裏可以找到支付寶小程序?
  • copyright 2024編程學習大全網