我們的大腦中同時存在著遠古的自我，和現代的自我，並且兩者並沒有完美協調，所以才會出現“如著作等身的教授，聰明的數學家，藝術家同樣有可能成為性引誘的犧牲品，同樣可能犯七宗罪，同樣可能成為焦慮和憂郁癥的患者”（《Synaptic Self》）（不禁讓人想起前陣子著名的泰格伍茲事件）。
然而除了這些極端情況之外，普通人也常常受到困擾——明知正確的事情就是沒法去做。仔細想想這簡直是壹句類似悖論的話：既然妳的大腦認可某種做法是正確的，而同樣又是妳的大腦主管妳的行為，那為什麽偏偏妳沒法執行呢？這就說明主管行為的並不僅僅是妳的“認知”模塊，認知模塊發完話之後自會有更強大的情緒模塊藐視“上級”的決定。所以我們常常哀嘆“說起來容易做起來難”。世界上最痛苦的事情不是和別人作鬥爭，而是和自己作鬥爭。《Phantoms in the Brain》提到這麽壹個有趣的例子：我們看到老朋友時會自然微笑，然而站在攝影師面前我們卻經常“擠”出難看而別扭的微笑。我們常常說第壹種微笑是發自內心的，第二種笑則是有意做出來的。事實上這兩種微笑的確涉及到兩種不同的機制，只不過不是心臟和面部肌肉，而是兩個不同的大腦模塊。自然、下意識的微笑來自於大腦中位於進化年代較古老的丘腦和進化年代較新近的大腦皮層之間的壹個叫做“基底核”（basal ganglia）的結構，而有意識的笑則是由大腦中的動作皮層控制的。而這兩者只有前者具有正版的微笑神經回路，當我們看到朋友的時候，朋友的臉龐的視覺映像通過視覺神經傳導到我們的情緒模塊（邊緣系統），並進而被轉發到基底核，後者的微笑回路負責調動面部肌肉生成壹個真正自然的微笑，整個過程在不到壹秒內完成，在這個時間裏妳的高級認知模塊根本還沒來得及活動呢。