第1集：旅行開始，從雙葉鎮到真沙鎮 （小光登場）（小智的長尾怪手歸隊）
第2集：尋找皮卡丘！202號道路！ ！（小智收服姆克兒，小次郎得到捕蟲草，小剛歸隊）
第3集：對戰勁敵 三對三 ！（小光加入）
第4集：圓企鵝對戰含羞苞 小光的初次戰鬥！
第5集：收服嫩苗龜（小智收服嫩苗龜）
第6集：迷惑之森，與真嗣的再度相遇
第7集：圓企鵝加油！
第8集：謎之道館的毒蟾鬥士！ （小剛收服毒蟾鬥士）
第9集：和卷耳兔壹起玩 （小光收服卷耳兔）
第10集：小精靈手表入手困難 （小光得到寵物小精靈手表）
第11集：小光！華麗大賽初登場！！
第12集：華麗大賽戰鬥!勁敵對決!
第13集：姆克兒加油! (小智的姆克兒進化成姆克鳥)
第14集：壹切交給小剛吧! （小剛的胡說盆栽進化成胡說樹）
第15集：黑鐵道館!平田對戰真嗣!
第16集：頭蓋龍VS皮卡丘!
第17集：古代小精靈大進擊!
第18集：再戰黑鐵道館!決戰暴槌龍 （小智得到黑鐵徽章）
第19集：收服電栗松沒問題? (小光收服電栗松）
第20集：小精靈獵人J ！
第21集：最強的鯉魚王與最美的笨笨魚!
第22集：電栗松VS長尾怪手!
第23集：爆走的大鋼蛇，守護大牙貍之村!
第24集：小智對抗皮卡丘!?
第25集：假面薔薇與花之傳說!
第26集：小精靈華麗大賽，索諾大會 ！
第27集：決戰，波加曼對波皇子! （小光第壹次得到緞帶）
第28集：鬼飄飄與北風的使者!
第29集：小智與小光，雙人合作賽沒問題!?
第30集：白岱之森，蓑衣蟲進化作戰!
第31集：嫩苗龜對嫩苗龜！速度對決!
第32集：琥珀之城的女皇蜂!
第33集：小精靈變裝大會 (小剛得到蛋)
第34集：叉尾浮鼬!通向最強的道路 （小光收服叉尾浮鼬）
第35集：四大天王五洋與古鐘圖騰!
第36集：新奧時空傳說!
第37集：白岱會館！對戰菜子! （小智得到三葉徽章）
第38集：高速自行車道上的偉大誕生!! (小剛的蛋孵化成粉紅蛋)
第39集：皮卡丘看家？！
第40集：冠軍，希羅娜登場 ！
第41集：小光與小希與雙人表演
第42集：落雷獸訓練中心！
第43集：巫妖！從惡夢中逃脫！！
第44集：幫助迷路的沼澤河馬！
第45集：獵人J再次登場！守護盾面龍
第46集：迷路曳行！全員緊繃！
第47集：美留與凱西與水之底！
第48集：小智與小光！迎向新的冒險！！
第49集：小精靈華麗大賽！茵緣大會！！
第50集：全員參加！雙人合作賽！！（小智遇見小火猴）
第51集：小火猴VS鐮刀貓鼬！命運之戰！！
第52集：雙人合作賽！決勝戰！！（小智收服小火猴）(信嗣的電擊怪進化成電擊獸）
第53集：小火猴之淚！
第54集：菜子與沙漠奈亞！再見是為了誰！（小次郎的沙漠奈亞離隊）
第55集：長尾猴與叉尾浮鼬！各自的道路！！（小光的叉尾浮鼬和小智的長尾怪手交換）
第56集：禦靈石的楔石！
第57集：呆水貍知道了！！
第58集：大磁鼻！熱血之魂！
第59集：雷電獅的眼睛！
第60集：隨鎮遺跡的未知圖騰！（小光的長尾怪手進化成雙尾小子)
第61集：寵物小精靈華麗大賽，隨鎮大會
第62集：女仆咖啡店的大奶罐
第63集：小山豬三只組與溫泉蒸氣對戰
第64集：滑翔天蠍與天蠍（小智收服天蠍怪，真嗣收服滑翼翔天蠍）
第65集：電栗松在沙河馬裏
第66集：路卡利奧，憤怒的波導彈
第67集：小光初次挑戰道館戰！
第68集：戶張道館！路卡利奧VS叉尾浮鼬！（小智得到格鬥徽章）
第69集：時髦的打扮！名叫銀河隊!
第70集：振作起來，小風鈴!
第71集：寵物小精靈護林員！波導的利奧爾！（前篇）
第72集：寵物小精靈護林員！波導的利奧爾！（後篇）
第73集：再見了 毒粉蝶！（武藏的毒粉蝶離隊）
第74集：皮卡丘！雷丘！通向進化的道路！！
第75集：華麗大賽尊者·米庫利登場！！(小遙登場！）
第76集：七星級餐廳！以聯協戰鬥享受豪華宴席！！（小遙歸隊！)
第77集：強敵雲集！米庫利杯！！
第78集：激鬥！各自的勁敵！！
第79集：決戰！小光對小遙！！(小遙離隊！）（小光贏得米庫利杯第壹名，贏得緞帶）
第80集：陽陽瑪！收服作戰！！（武藏收服服陽陽瑪,陽陽瑪進化成梅卡陽瑪）
第81集：灼熱的小火猴！
第82集：野瀨大濕原的毒蟾鬥士慶典！？
第83集：野瀨會館！VS最強的假面！！
第84集：裏山先生家的大食客小山豬！(小光收服小山豬)
第85集：天蠍！友情之翼!!(小智的天蠍怪進化成滑翔鉗蠍)
第86集：茵緣時裝系列發布會！通往小精靈造型師之路！！
第87集：擋路的可達鴨
第88集：寵物小精靈夏日學校課程!（進入訓練學校）（小葵登場）
第89集：研究發表『湖之傳說』！
第90集：放學後是幽靈時間！
第91集：最後的大勝負！寵物小精靈鐵人三項！！（離開訓練學校）
第92集：回歸原點的火箭隊！？
第93集：跳的拳擊練習場領導人！梅麗莎登場！
第94集：電栗鼠發燒了! 兩人來看護!?
第95集：小精靈華麗大賽！神巫大會！
第96集：銀河團的襲擊！！(前篇）
第97集：銀河團的襲擊！！(後篇）
第98集：漂浮的未知怪物！？（再次遇見小葵）
第99集：四天王阿柳！相會與離別之森！
第100集：嫩苗龜、樹林龜…然後土臺龜！（小智的樹苗龜進化為樹林龜）
第101集：勁敵訓練家·小純登場！！
第102集：緣之道館戰！對抗梅麗莎！！（小智得到茵緣徽章,武藏獲得第二個緞帶勛章）
第103集：混戰混亂 水脈市！
第104集：克雷色利亞對抗達克萊伊！ （小光的小山豬進化為長毛豬）
第105集：羊羹與洛托姆！
第106集：與神奇寶貝友好相處之道！？ （小光的長毛豬進化為獠牙豬）
第107集：戰槌龍對抗護城龍！！
第108集：水脈道館戰！鋼鐵的對戰！！（小智得到鋼鐵徽章）
第109集：迷路的吼吼鯨！
第110集：阿玄與路卡利歐！
第111集：鋼鐵島的遺跡！
第112集：皮卡丘與圓企鵝漂流記！
第113集：惡作劇的霏歐納
第114集：神奇寶貝華麗大賽！通草大會！！（小光得到通草緞帶）
第115集：野蠻的君莎與搭檔音符鵲!
第116集：暴風雪中的雪妖女!
第117集：火箭隊解散!?
第118集：神奇寶貝圓環！天空大決戰!!(小智的姆克鳥進化成姆克鷹）
第119集：激烈沖突!象牙豬對抗波士可多拉！！
第120集：教學!神奇的口袋中的寶貝!!
第121集：孤獨的雪笠怪！
第122集：進化，這次是圓企鵝！？
第123集：神奇寶貝華麗大賽 立浪大會!!
第124集：神奇寶貝乒乓大會！雙尾小子加油！！(小光的雙尾小子離隊)
第125集：櫻花寶！勇氣對戰!?
第126集：訓練家培育學園的鈴奈老師！
第127集：切鋒道館！冰之對戰!!（小智得到冰河徽章）
第128集：對戰金字塔！真嗣對抗神代
第129集：復活的雷吉奇卡斯！J再度登場!!
第130集：電龍列車！“好看”登場!!
第131集：全員對戰！真嗣對抗小智!! -前篇！
第132集：全員對戰！真嗣對抗小智!! -後篇！（小智的小火猴進化成猛火猴）
第133集：由克希之影 !
第134集 森林之王,巨蔓藤
第135集 全員參戰 神奇寶貝齊心協力
第136集 時間和空間！銀河團的野心！
第137集：瑪力露·波加曼·電擊怪!
第138集：小光對抗媽媽！親子對決!!
第139集：救出大木博士！牛蛙君對抗不良蛙!!
第140集：天然雀，天然鳥…不可思議的森林！
第141集：對戰塔大君！那位男子叫山棕!!
第142集：歷史上最壞的波克比！
第143集：成都之日！菊草葉與小鋸鱷登場!!