獨立樣本和配對樣本的區別如下：
1、包括的範圍不同
獨立樣本包括：行政管理和技術人員，材料采購、保管和駕駛各種機械、車輛的人員，材料到達工地倉庫前的搬運裝卸工人，專職工會人員、醫務人員以及其他由施工管理費或營業外支出開支的人員的工資。
而配對樣本包含：個人從事設計、裝潢、安裝、制圖化驗、測試、醫療、法律、會計、咨詢、講學、新聞、廣播、翻譯、審計、書畫、雕刻、影視、錄音、錄像、演出、表演、廣告、展覽、技術服務、介紹服務、經紀服務、代辦服務以及其他勞務取得的所得。
2、計算方法不同
獨立樣本計算公式為：
經營凈收入=經營收入-經營費用-生產性固定資產折舊-生產稅+
出租房屋凈收入、出租其他資產凈收入和自有住房折算凈租金等。財產凈收入不包括轉讓資產所有權的溢價所得。
轉移凈收入 計算公式為：轉移凈收入=轉移性收入-轉移性支出
而配對樣本計算公式表示為：人均可支配收入實際增長率= （報告期人均可支配收入/基期人均可支配收入）/居民消費價格指數-100%。
3、作用不同
獨立樣本反映的是壹個國家或地區農村居民收入的平均水平，而配對樣本反映的是人民的生活水平。
4、處理方法不同
按照獨立樣本企業工資應按年計算，分月或分季預繳。每月終了，企業應將成本費用和稅金類科目的月末余額轉入“本年利潤”科目的借方，將收入類科目的余額轉入“本年利潤”科目的貸方。
然後再計算“工資”科目的本期借貸方發生額之差。
而配對樣本的首要目的應是確認並計量由於會計和稅法差異給企業未來經濟利益流入或流出帶來的影響,將所得稅核算影響企業的資產和負債放在首位。而收益表債務法從收入費用觀出發,認為首先應考慮交易或事項相關的收入和費用的直接確認,
從收入和費用的直接配比來計量企業的收益
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