2006年9月6日上午8:27，悠仁在東京愛育醫院出生。由於母親紀子妃出現了嚴重的妊娠並發癥前置胎盤，因此悠仁是日本皇室第壹位剖宮產出生的皇族。根據日本皇室典範（日本平假名：こうしつてんぱん）規定 ，悠仁為第二順位皇位繼承人，尊稱為殿下（日本平假名：でんか）。他有兩位姐姐，分別是真子內親王和佳子內親王。 日本皇族中年齡最小的男性成員，將來有可能繼承皇位。自從秋筱宮文仁出生以後，日本皇室就壹直沒有男性後裔出生，這帶來非常嚴重的繼承問題。因為明仁的兩名嫡子，長子德仁及次子文仁，在此之前皆沒有男性子嗣，所以悠仁的出生對日本皇室的傳承來說非常重要。
日本現行的皇家典範規定，女性皇族無法繼承皇位，成年後也不像男性皇族能創設宮家，而降嫁後便自動脫離皇籍成平民。 由於日本皇室從1965年到2006年間沒有男子誕生，皇位在延續幾代之後面臨後繼無人的可能，因此日本國會壹度考慮修改皇室典範，允許女性皇族繼位，並容許其和平民結婚傳位給後代，或者恢復二戰之後廢除的宮家成員之後代的皇族身份。但在天皇次子秋筱宮文仁親王的妻子秋筱宮妃紀子在2006年9月6日得子悠仁親王之後，修改皇室典範的程序被擱置。
從這裏就可以看出開，小皇子悠仁的出生給日本帶來了很大的變化，作為順位第二的皇位繼承人，悠仁親王的權利也是很大的。日本皇室出街都是可以清場的，就是提前安排好不允許平民進入皇室可能經過的街道。日本皇室每年的內廷費約為3億日元（超過2000萬人民幣）。其他皇室成員的生活費被稱作?皇族費?，每名單獨立戶的男性成員每年擁有的皇族費為2700萬日元，沒有選舉權和被選舉權但可以免稅。?